Margenat fundó en 2006 Weekendesk Iberia, la empresa que introdujo en España los bonos de regalo temáticos bajo la marca Bongo, y de la que fue el CEO hasta 2009, cuando el Grupo Francés Smart&Box compra la compañía.

Ingeniero en Caminos, Canales y Puertos en la UPC y MBA por ESADE Business School, Margenat comenzó su carrera profesional en el campo de la ingeniería en la firma Auding, consultora de planificación, diseño y supervisión de obras civiles, para incorporase más tarde a Jones Lang LaSalle. Durante seis años, fue Consultor Senior de Inversiones en la firma de servicios financieros y profesionales, especializada en servicios inmobiliarios y gestión de capitales.

En 2009 fundó Plan B! junto con el Grupo Barceló, con el objetivo de convertirse en líderes del mercado español combinando el know-how de Margenat en el sector de las cajas regalo y los más de 75 años de experiencia de Barceló, líder del sector turístico en España.

Juan es business angel de varias startups como Deporvillage, Kantox u Offerum, y desde finales de 2012 está al frente de Marfeel junto a Xavi Beumala, como COO y cofundador.